Bacteroidetes vispārējās īpašības, sistemātiska, zarnu mikrobiota

Bakteroidetes tā ir viena no malām, kurās klasificētas baktērijas. Šī mala sastāv no četrām klasēm (Baktērijas, Flavobaktērijas, Sfingobaktērijas un Citofāgija ) un vairāk nekā 7000 dažādu sugu, kas ir kolonizējušas visu veidu biotopus uz Zemes.

Tās atrodas augsnē, aktīvajā dūņās, sadalot augu materiālus, kompostu, okeānus, saldūdeni, aļģes, piena produktus un slimus dzīvniekus. Izplatīts mērenās, tropiskās un polārās ekosistēmās. The Bakteroidetes atklātās dzīvotnēs izolēti galvenokārt Flavobacteria, Cytophagia un Sphingobacteria klasēs.

Bakteroidetes ir svarīga cilvēka zarnu trakta un citu zīdītāju un putnu daļa. Cilvēkiem viņi iejaucas imūnsistēmas aktivizēšanā un uzturā, noārdoties polisaharīdiem un ogļhidrātiem, kas rada blakusproduktus, ko uzņēmēja uzsūc, kas ir svarīgs enerģijas avots..

Bacteroidetes phyllo sugas lielākoties nav patogēnas, izņemot ģints Baktērijas, ko veido oportūnistiski patogēni un daži Flavobacteriaceae, kas ir patogēni cilvēkiem, citiem zīdītājiem, saldūdens zivīm vai jūras zivīm..

Indekss

• 1 Vispārīgi raksturlielumi
• 2 Sistemātika
  • 2.1. I. klase. Baktērijas
  • 2.2. II klase. Flavobaktērijas
  • 2.3 III klase. Sfingobaktērijas
  • 2.4 IV klase. Citofāgija
• 3 Zarnu mikrobiota
  • 3.1 Mutualisms
  • 3.2. Žultsskābju metabolisms
  • 3.3 Enerģijas uztveršana
• 4 Atsauces

Funkcijas vispārīgi

Baktērijām, kas klasificētas šajā patvērumā, ir kopīga evolūcijas vēsture un plaša morfoloģiskā, fizioloģiskā un ekoloģiskā daudzveidība. Tie var būt īsie vai garie stieņi, taisni, viendabīgi vai plāni pavedieni. Tie ir gramnegatīvi un nerada endosporus.

Tās var būt anaerobas vai stingri aerobiskas. Tie var būt ne-mobilie, ar karodziņiem vai pārvietoties, bīdot.

Tie ir ķīmiski organotrofi, aerobiski vai fakti, kas ir anaerobi ar elpošanas vielmaiņu, lai gan ir dažas sugas ar fermentatīvo metabolismu..

Sistemātika

Mala Bakteroidetes, pazīstams arī kā grupa Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides, Tā sastāv no četrām klasēm: Baktērijas, Flavobaktērijas, Sfingobaktērijas un Citofāgija, grupā ir vairāk nekā 7000 dažādu sugu.

Iepriekšējās klasifikācijās Bacteroidetes patvērums sastāvēja no trim klasēm (Bacteroidia, Flavobacteria un Sphingobacteria). Tomēr jaunākie pētījumi, kas balstīti uz 16S rRNS gēna secību analīzi, pamato ceturtās klases veidošanos šajā patvērumā, citofagijā..

Šī jaunā klase ietver daudzas iepriekš klasificētas ģints, kas pieder pie Flexibacteraceae, Flammeovirgaceae un Crenotrichaceae ģimenēm. Tāpēc Bacteroidetes patvērums ietver vismaz četras filogenētiskas grupas, kas ir labi iezīmētas.

I klase. Baktērijas

Šajā klasē ietilpst viens pasūtījums, ko sauc par Bacteroidales. Pasūtījumā pašlaik ir piecas ģimenes: Bacteroidaceae, Marinilabiliaceae, Porphyromonadaceae, Prevotellaceae un Rikenellaceae.

To pārstāv vairāk nekā 850 sugas. Šīs šķiras šūnas ir taisnas, vārpstveida vai plānas kokcobacīļi ar gramnegatīvu krāsošanu. Tie nesatur sporas.

Tās galvenokārt ir anaerobas, lai gan dažas ir fakultatīvi anaerobas. Tās fermentē vienkāršu ogļhidrātu, radot butirātu kā fermentācijas produktu, lai gan tās var noārdīt proteīnus un citus substrātus. Tie ir mobilie vai mobilie, bīdot.

II klase. Flavobaktērijas

Flavobacteriia klase ietver vienu kārtu, ko sauc par Flavobacteriales. Pasūtījumā pašlaik ir trīs ģimenes: Flavobacteriaceae, Blattabacteriaceae un Cryomorphaceae. Tas ir lielākais bakterioīdu slimību klase, kas sastāv no vairāk nekā 3500 sugām.

Šūnas ir stieņi vai pavedieni, kas nesatur sporas, ir gramnegatīvi, bez gāzes vezikulām un intracelulārām granulām. Parasti reizina ar bināro šķelšanos.

Blattabacteriaceae ģimenes locekļi ir kukaiņu intracelulāri simbionti. Ģimenēm Flavobacteriaceae un Cryomorphaceae veido aerobās vai fakultatīvās anaerobās ķīmijorganiskās baktērijas ar elpošanas vielmaiņu, lai gan ir dažas sugas ar fermentatīvo metabolismu..

Tie nav mobilie. Daudziem šo ģimeņu locekļiem ir vajadzīgs NaCl vai jūras ūdens sāls.

Flavobacteriaceae ģimenes locekļi ir plaši izplatīti augsnē vai svaigā, iesāļā vai jūras ūdenī mērenos, tropiskos vai polāros apgabalos, savukārt Cryomorphaceae ģimenes locekļi līdz šim ir ierobežoti ar zemas temperatūras jūras dzīvotnēm..

Daži Flavobacteriaceae ģimenes locekļi ir patogēni cilvēkiem, zivīm vai abiniekiem.

III klase. Sfingobaktērijas

Šajā klasē ietilpst tikai Sphingobacteriales pasūtījums, kurā ietilpst trīs ģimenes (Sphingobacteriaceae, Chitinophagaceae un Saprospiraceae), 29 ģints un 787 sugas.

Šāda veida baktērijas ir stieņa formas. Tie nav mobilie, nevis sporas veidojoši, ar gramnegatīvu krāsošanu. Aerobiskais vai fanto- tīvi anaerobais augums.

Ar dažiem locekļiem ir ierobežotas fermentatīvās spējas. Daži žanri, galvenokārt Sphingobacterium, satur lielas sfingofosfolipīdu koncentrācijas kā šūnu lipīdu sastāvdaļas.

IV klase. Citofāgija

Šajā klasē ietilpst tikai Cytophagales un dažas citas filogenētiskās grupas, kas tiek uzskatītas par pasūtījumiem incertae sedis, nosaukts, lai norādītu uz nespēju tos tieši klasificēt šajā klasifikācijā.

Šīs klases šūnas var būt īsas, garas stieņi vai pavedieni. Dažas sugas veido gredzenus, spoles vai šūnas S formā. Tās neražo sporas, izņemot ģinti Sporocytophaga. Tās ir mobilas, bīdot vai nepārvietojot. Vienīgā ģints ar flagella ir Balneola. Gram-negatīva krāsošana.

Pieaugums parasti ir stingri aerobisks, bet dažos dalībniekos notiek mikroaerobais un anaerobais augums. Tie ir chemoorganotrofiski. Tie ir plaši izplatīti dabā.

Dažas ģints ir jūras organismi, kuriem augšanai nepieciešami jūras ūdens sāļi. Lielākā daļa sugu ir mezofīlas, bet ir psihofiliski un termofīli.

Zarnu mikrobiota

Bakteroidetes ir kolonizējušas dažādās kuņģa-zarnu trakta daļas cilvēkiem. Tie ir atrodami arī citu zīdītāju, piemēram, adatādaiņu, peles, suņu, cūku un atgremotāju mikrobiotā; mājputnu un savvaļas putnu, piemēram, cāļu, tītaru, zosu un strausu; bezmugurkaulniekiem, piemēram, milpijām un termītiem.

Mutualisms

Vairumam Bacteroidetes ir savstarpējās attiecības ar saviem viesiem. Cilvēkiem tie mijiedarbojas ar imūnsistēmu, kas izraisa T-šūnu mediētu reakciju aktivizēšanu un kontrolē potenciālo patogēnu baktēriju kolonizāciju..

Šīs baktērijas parasti ražo butirātu kā fermentācijas galaproduktu, kam piemīt antineoplastiskas īpašības un tādēļ tai ir svarīga loma zarnu veselības uzturēšanā..

Žultsskābes vielmaiņa

Tās piedalās arī žultsskābju metabolismā un toksisku un / vai mutagēnu savienojumu pārveidošanā. Veicināt polisaharīdu sadalīšanos resnajā zarnā, molekulām, kuras ir grūti sadalīt zīdītājiem, rezistentu pret gremošanas fermentu iedarbību..

Šo polisaharīdu fermentācija, ko izraisa baktērijas, izraisa īsas ķēdes gaistošo taukskābju (galvenokārt acetāta, propionāta un butirāta) izdalīšanos, ko saimnieks atkārtoti absorbē. Tāpēc šīs zarnu baktērijas palīdz uzņēmējam iegūt enerģiju no ugunsizturīgiem ogļhidrātu avotiem.

Enerģijas uztveršana

Visaugstajiem zīdītājiem, īpaši cilvēkiem, šis papildu enerģijas avots ir no 7% līdz 10% no dienas naudas. 

Žurkām pierādīts, ka dzīvnieki bez kauliem izdalās 87% vairāk kaloriju izkārnījumos nekā viņu parastie kolēģi, un viņiem ir nepieciešams uzņemt 30% vairāk pārtikas, lai uzturētu ķermeņa svaru..

 Tāpēc zarnu mikrobiota klātbūtne ir nepieciešama optimālai enerģijas uzņemšanai no uztura

Atsauces

1. Hahnke, R. L., J P. Meier-Kolthoff, M Garcia-Lopez, S Mukherjee, M Huntemann, N N. Ivanova, T Woyke, N C. Kyrpides, Hans-Peter, K. un M. Göker. (2016). Baktēriju slimību genomās balstīta taksonomiskā klasifikācija. Frontiers in Microbiology, 7: 2003.
2. Wikipedia dalībnieki. Bakteroidetes [tiešsaistē]. Vikipēdija, Brīvā enciklopēdija, 2017 [konsultāciju datums: 2018. gada 10. oktobris]. Pieejams vietnē es.wikipedia.org
3. Johnson, E.L., Heaver, S.L., Walters, W.A. un Likums, R.E. (2017). Mikrobioma un vielmaiņas slimība: Bakteroidetes bakteriālās patvēruma pārskatīšana. Journal of Molecular Medicine, 95 (1): 1-8.
4. Krieg, N.R., J. T. Staley, D. R. Brauns, B. P. Hedlund, B. J. Paster, N. L. Ward, W. Ludvigs un W. B. Whitman. (2010) Bergey rokasgrāmatā Sistemātiska bakterioloģija: Volume 4: Bacteroidetes, spirohetām, Tenericutes (Mollicutes) acidobaktērijas, fibrobacteres, Fusobacterium, Dictyoglomi, gemmatimonadetes, lentisphaerae, Verrucomicrobia, hlamīdijas, un planctomycetes. ASV.
5. Toms, F. Hehansans, J.H., Rebuffets, E., Čjžeks, M. un Mišels, G. 2011. Vides un zarnu baktērijas: pārtikas savienojums. Robežas mikrobioloģijā 2: 93.